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生物發酵罐溫度對發酵過程的影響是多方面的，它會影響各種酶反應的速率，改變菌體代謝產物的合成方向，影響微生物的代謝調控機制。在生長階段，應選擇適生長溫度，在產物分泌階段，應選擇適生產溫度。
生物發酵罐控制進氣閥排氣閥的大小可以調整通氣量和罐壓，控制攪拌轉數使發酵溶氧滿足工藝要求。發酵時打開罐體進水總閥，打開夾套出水閥和夾套進水閥，此時系統自動通過控制夾套水溫控制發酵溫度。
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